如何找到完整的生物信息分析流程/脚本？？

有没有一套标准通用的分析流优艾设计网_设计程或是脚本，R/perl/python/Linux等等可以下载或者参考呢？
我看过一些Rbioconductor上面的workflows，
想找多一些这方面的资源，参考模仿一下。
不知道有没有公共的资源呢？
之前在Galaxy上面也看过一些Published workflows，
只是没有系统的整理。

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薛晓煌 2021-04-02 07:40

优艾设计网_PS问答
建议GATK best practices： https://www.broadinstitute.org ... tices

可以对照着下面几个中文网站看，帮助理解
GATK使用方法详解（原始数据的处理）：http://www.plob.org/2014/04/14/7009.html
GATK使用方法详解（实例：对SNP结果进行校正）：http://www.plob.org/2014/04/14/7026.html
GATK使用方法详解（实例：对INDEL结果进行校正）：http://www.plob.org/2014/04/14/7029.html
GATK使用方法详解（初步分析）：http://www.plob.org/2014/04/14/7035.html
GATK使用方法详解（变异检测）：http://www.plob.org/2014/04/14/7023.html

注释可以看看annovar，snpeff

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刘云鸿 2021-04-02 07:52

优艾设计网_Photoshop百科
需求不同，实现不同。并没有一套大一统的解决方案。

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