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还说BGI的de novo产品会支持PACBIO的r优艾设计网_Photoshop论坛eads组装。
吴擒虎 2021-04-27 16:27 优艾设计网_电脑技术
现在三代PacBio RS II测序仪基本集中在天津,人才也都集中在这里。
华大这时候进入,是有绝对实力吃掉这几家小公司,但是,很容易再出现类似二代测序那样混乱的恶性竞争场面,然后导致我们国家大量经费浪费在买设备,买试剂,为西方国家测试设备。
华大当年买那么多illumina的hiseq,其实很长一段时间都是在帮别人测试设备,每次测序稳定了,那边就升级机器神马的,然后又不稳定又总是测坏然后客户就不满意,然后好不容易稳定,人家又升级。。。
现在PacBio RS II测序仪产能过剩,开工不足十分之一,请不要再买设备了,都是老百姓的血汗钱啊。
魏可欣 202优艾设计网_Photoshop问答1-04-27 16:31
SOAP支持PACBIO的长reads组装吗?这方面的文献我貌似看过,据说NGS的组装工具对于PB长读长的支持效果不好。具体速度如何呢?
罗珍 2021-04-27 16:53
PacBio® RS II测序系统的供应商 Pacific Biosciences of California 5月4日宣布,世界最大基因组学中心华大基因(BGI)已经购入了首台 PacBio RS II设备,并且仍有后续购买计划以将单分子实时(SMRT®)测序整合入其全球服务产品。
“SMRT测序有长读长和更高的组装准确度,这将使它为BGI的de novo基因组服务提供有力支持。”华大基因CEO王俊博士说。“对那些高度重复或杂合的复杂基因组而言,PacBio系统是首选。我们期待PacBio RS II能优艾设计网_设计客助我们达成将完整的基因组交付给客户,并提供最佳的动植物和人类的参考序列这一目标。”
PacBio RS II 系统能产生业内最长的读长,并且能做到无偏覆盖基因组,精准度很高。这些特性使得用户可以得到基因组中完整的变异谱图,无论是SNP(单核苷酸多态位点)还是复杂的结构变异,甚至可以测那些以往的测序技术无法测得的基因组区域。此外,SMRT测序是唯一能直接检测碱基修饰,完整基因和染色体单倍域中碱基变异信息的技术。
PacBio Biosciences公司CEO Michael Hunkapiller表示,“作为领先世界的最大测序机构,BGI选择了PacBio的技术,是对PacBio的极大肯定。而BGI在生物信息分析方面也位列世界前沿,我们很高兴BGI将产出更多SMRT的数据,并且很有可能开发出更多的分析软件来使得这些数据的价值能充分为人所知。”
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