RNA测序为什么会出现？与基因表达芯片相比，RNA测序有什么特点？？

wuxiansheng 2021-05-20 08:34

RNA测序也就是所谓的RNA-seq，通常指的是转录组测序，只测细胞中的转录组，所以数据相对少且简单。RNA测序不仅能检测mRNA的转录，还能观测到包括包括总RNA和小RNA（miRNA、tRNA和核糖体RNA）在内不同尺度的R优艾设计网_Photoshop问答NA表达谱，相对于RNA测序，基因表达芯片测序结果的覆盖面很窄，只能覆盖染色体中1千多万SNP中的常见等位基因的SNP（50万到200万）。

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野莓Marry 2021-05-20 08:38

RNA测序（英语：RNA Sequencing，简称RNA-Seq，也被称为全转录物组鸟枪法测序:Whole Transcriptome Shotgun Sequencing[1]，WTSS）是基于第二代测序技术的转录组学研究方法：首先提取生物样品的全部转录的RNA，然后反转录为c-DNA后进行的二代高通量测序，在此基础上进行片段的重叠组装，从而可优艾设计网_PS问答得到一个个的转录本。进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解（globle）。
如同楼上所说，RNA测序有很多优势。此外，若和下一阶段的生物样品的RNA-Seq转录组进行比较，则可以得到全部的（在转录层面）基因表达的上调及下调--这就形成了表达谱，针对关键基因则可以形成你要想要的pathway的构建。
相较于一个静态的染色体而言，细胞内的转录物组是一个处于不断变化的动态过程。随着现在的下一代基因测序（NGS）技术的发展，使得可测得的DNA碱基覆盖面增加且样本输出的吞吐量增大。有助于对细胞内RNA转录物进行测序，提供包括选择性剪接的转录、转录后的改变、基因融合、突变/SNPs以及基因表达量改变等细节。
正因为RNA测序可以检测动态过程，因而优势非常明显。

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崔默 2021-05-20 08:39

优艾设计网_PS论坛
RNA测序的优势：
数字化信号：直接测定每个转录本片段序列，单核苷酸分辨率的精确度，同时不存在传统微阵列杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题。
高灵敏度：能够检测到细胞中少至几个拷贝的稀有转录本。
全基因组分析：可以对任何物种进行全基因组分析。无需预先设计特异性探针，因此无需了解物种基因信息，能够直接对任何物种进行转录组分析。同时能够检测未知基因，发现新的转录本，并精确地识别可变剪切位点及cSNP，UTR区域。
检测范围：高于6个数量级的动态检测范围，能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。

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