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转录组测序的优势是什么??

优艾设计网 https://www.uibq.com 2023-01-07 09:33 出处:网络 作者:PS教程自学
118****100 2021-06-03 09:05 虽然转录组测序(RNA-Seq)技术还面临着种种困难,但作为一个刚刚起步的新技术RNA-Seq已经显示出其他转录组学技术无可比拟的优势:既能提供单碱基分辨率的转录组注释又能提供全基因
118****100 2021-06-03 09:05


虽然转录组测序(RNA-Seq)技术还面临着种种困难,但作为一个刚刚起步的新技术RNA-Seq已经显示出其他转录组学技术无可比拟的优势:既能提供单碱基分辨率的转录组注释又能提供全基因组范围的“数字化”的基因表达谱,而且其成本通常比芯片和大规模的Sanger EST测序要低优艾设计网_PS交流,有人甚至提出了RNA-Seq最终取代基因芯片的猜测。然而就目前来看,作为两个高通量的转录组学研究技术,在应用的某些方面既存在重叠和竞争也存在优势互补,一种技术能弥补另一种技术遗漏的部分,通常对一个生物学问题的回答需要不同实验技术的协同配合,例如序列捕获技术就是结合了芯片和深度测序,利用芯片探针捕获待测片段,再用深度测序技术分析核酸序列。但基因芯片的缺点,就在于它是一个“封闭系统”,它只能检测人们已知序列的特征(或有限的变异);而RNA-Seq的强项,就在于它是一个“开放系统”,它的发现能力和寻找新的信息的能力从本质上高于芯片技术,相信随着相关学科的进一步发展和测序成本的进一步降低,RNA-Seq必将在转录组学研究领域占主导地位。


蓝呱呱瓜 2021-06-03 09:09


个人觉得转录组测序优势还是比较大的。
转录组测序是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。转录组可以选定某个特定时期的所有转录产物,这样就可以用来研究某一生理条件或时空条件下该物种转录水平和正常情况下的差异。这些测序结果相对于基因组来说,数据更少,更方便分析,此外转录组测序最大的好处是费用比较低。相对于高通量测序来说优艾设计网_Photoshop问答,这个费用要少很多。


ty_信念738 2021-06-03 09:13


2013年Nature上发表了一项研究,使用转录组测序技术对来自“1000 Genomes Project”的462个人的类淋巴母细胞系的信使RNA和微RNA进行测序,并且对人类基因组中的调控变化进行了深度分析。结果显示,绝大部分基因的调控的影响上普遍存在基因变化,其中转录结构和表达水平的变优艾设计网_设计客化同样普遍。这个结果比全基因组测序具有更直接的功能性。


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