两个高度相似的基因,需要做qPCR来看表达量,但是由于序列相似性太高,引物的设计都成优艾设计网_Photoshop论坛为了难题,该怎样解决?
孟宪羽 2021-06-06 03:42 优艾设计网_Photoshop交流
可以先做blast,分析出有非同源的位点,再设计引物。设计好以后再在NCBI上做个primer-blast看一下特异性。设计p16ink4a和p19arf的引物时,我先看表达这两个基因的不同exon,再在不同的exon上设计引物,得到的引物特异性就很好。
天下第六 2021-06-06 03:52
对于高度保守的两个基因来说肯定会有不相同的碱基,设计引物的时候将引物设计在优艾设计网_设计百科两个基因的差异序列那里,然后再进行荧光定量PCR,如果两个基因特别相近,就多设计几对引物先跑个基本的PCR,要是一条能扩增另一条不能的话估计应该能行。
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