外显子组测序的技术限制有哪一些?？

sissi_ly 2021-06-07 03:55

尽管外显子组测序在人类疾病优艾设计网_Photoshop交流的遗传学研究中取得了极大的成功,但该技术本身也存在一些缺点,主要包括外显子捕获效率及测序正确率。为了系统评价外显子组测序技术对致病突变的检测效率,Gilissen等对51个外显子组测序数据的37424个SNP位点进行了分析。共有35296个突变位点被成功捕获,捕获成功率为94.3%;测序深度在10x以上的突变位点约占全部位点的80.8%,其中不能被成功检测的位点所在区域大都显示过高或过低的GC含量。研究表明,对GC丰富的基因组区域而言,打断捕获和基于多重PCR的捕获方式均具有较高的捕获能力;但对AT丰度的基因组区域而言,在捕获时会出现很大的偏差。除基因组本身过高或过低的GC或AT含量及其特殊结构之外,所有外显子组捕获试剂盒的探针设计都不能实现对外显子区域100%的覆盖度,使得部分外显子区域成为测序盲区。随着全基因组测序费用的进一步降低,采用全基因组测序,替代外显子组测序,进行遗传变异的挖掘将会是必然的趋势。

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袁浩家 2021-06-07 04:04

外显子组测序也称目标外显子组捕获，是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。
总的来说还是高效率的，因为：
1、定位克隆，降低功耗，成功地确定优艾设计网_设计圈罕见变异，
2、大部分导致孟德尔遗传紊乱的基因变异是通过破坏蛋白质编码形成的，
3、大量的非同义替换是有害的，
4、剪接位点也代表序列的主要功能的变化。

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