随着测序技术的发展优艾设计网_设计LOGO,现在已知很多肿瘤不止含有一类癌细胞,可能有多种细胞类型掺杂,区分清楚患者体内肿瘤的癌细胞种类,有利于后期的个性化治疗。那么现在有没有好的分析方法可以针对肿瘤区分癌细胞种类呢?
绿萝叶散 2021-06-12 14:07
可以的。
美国一个研究所今年新研发出一种新的数据统计模型,叫做GLAD,能利用肿瘤RNA测序的数据分析肿瘤中的癌细胞类型及比例。这种模型改进了过去对于肿瘤细胞分类采取的“全或无”模式,即针对一种肿瘤只能发现其中最主要类型的癌细胞。这样的诊断方法可能对后期治疗有误导作用,毕竟每种药物一般只能针对一种癌细胞有效,而对肿瘤中的其他类型癌细胞可能完全没用。这种新研发的GLAD模型能够较准确的判断肿瘤组织中各类型癌细胞的相对比例,这对于后期的个性化治疗是很有帮助的,可以使医生采用联合治疗方法对付肿瘤组织中的各种癌细胞,调整用药方案和方法。
这种模型被命名为GLAD,主要源于它利用了三种统计分布函数,分别是高斯、拉普拉斯和狄利克雷(Gaussian, Laplace, and Dirichlet)。它的使用主要基于肿瘤组织的RNA-seq数据,通过分析各基因表达量的情况来获取肿瘤中癌细胞种类。最早,这种方法被应用于一组模拟数据,该数据模拟了一种肿瘤中的两类癌细胞,GLAD成功识别出两种细胞的各自比例。之后,GLAD又利用一组含有小鼠肺、脑和肝细胞样本的基因表达数据进行分析,也成功再现了这些细胞的比例。最后,科研团队还从癌症基因组图谱项目中找到了202例恶性胶质瘤的基因表达数据,利用GLAD方法进行分析,成功确认了这些胶质瘤中的四类癌细胞,并准确预测了每一类的比例。这些验证和测试体现了此方法的可行性,据研究团队透露,下一步他们将与一些临床机构合作,使用这个方法来对乳腺癌病人优艾设计网_设计圈进行测试,希望能将这个方法应用于病人小样本活检,以将检测结果与病人症状关联,确定下一步的用药方案。
精彩评论