甲基化是基因组DNA的优艾设计网_设计模板主要表观遗传修饰形式,现在有哪些方法可以检测全基因组的甲基化水平呢?
M22****3735 2021-08-03 20:53
全基因组的甲基化检测也是高通量检测,现在已经有了多种技术手段来检测全基因组的甲基化水平。
传统的定量测定基因组整体DNA甲基化水平的方法是高效液相色谱柱(HPLC)法,将DNA水解后的产物通过高效液相色谱,用紫外吸光色谱测定其吸收峰值及量,计算峰面积就可以得到DNA甲基化水平。在此基础上,高效毛细管电泳法(HPCE)也能分析DNA水解产物,而且更加简便、快速、经济。还有一些HPLC相关方法,比如变性高效液相色谱法,可以用于检测单核苷酸和DNA分子。
SssI 甲基转移酶法,原理是放射性标记后3H-S-腺苷甲硫氨酸(3H-SAM)会在SssI甲基转移酶作用下使基因组甲基化。而由剩余的放射性标记的SAM的量就可得到原基因组整体甲基化水平,因优艾设计网_在线设计为剩余的放射性强度与所测DNA甲基化水平成反比。
免疫化学法也可以测量基因组整体水平的甲基化,经过荧光素标记的抗体可以与样本DNA特异性结合,仪器扫描得到的荧光素强度与甲基化程度成正比。
氯乙醛法是比较新的测量基因组整体水平的甲基化的方法,它的原理是氯乙醛可以与胞嘧啶反应生成带有强荧光的乙烯胞嘧啶。操作过程是先将样本DNA与重亚硫酸盐反应,未甲基化的胞嘧啶会转变为尿嘧啶,通过银处理掉DNA链的嘌呤后,加入氯乙醛,剩下的甲基化胞嘧啶就转变为乙烯胞嘧啶了 。通过检测荧光强度就可以得到甲基化水平。
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