什么是双链DNA微阵列芯片技术？？

青汐雨霖霖 2021-08-08 08:53

dsDNA微阵列芯片也称蛋白结合微阵列芯片,最早报优艾设计网_在线设计道于1999年,当时美国Harvard大学Bulyk实验室在Affymetrix公司原位合成的单链DNA微阵列芯片的基础上,采用引物退火再进行DNA聚合酶延伸的办法制备dsDNA微阵列芯片。该类芯片在玻片表面固定成千上万的双链DNA探针分子(如含有10碱基随机组合序列的410个探针),每个探针分子上都含有一个待考察的与某一转录因子蛋白可能结合的DNA位点;将一种转录因子蛋白与这样的dsDNA微阵列芯片反应,就可以在一次实验中获得该转录因子蛋白与大量DNA位点的结合信息,包括结合的特异性及相对亲和性。目前,随机组合序列(k-mer)高密度dsDNA微阵列芯片已经成功地用于绘制转录因子的体外DNA结合谱[75~77],使得转录因子及其他DNA结合分子的体外DNA结合谱研究取得了巨大的进展。截止2009年,Bulyk实验室已经运用PBM技术成功绘制了104个小鼠转录因子蛋白的精细DNA结合谱,这对认识大量转录因子的DNA结合特异性、亲和性等生物学特征发挥了重要作用。这些研究还表明PBM技术可高通量鉴定转录因子蛋白的顺式调控元件和绘制转录调控网络。

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