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如何查找一个基因的转录起始位点??

优艾设计网 https://www.uibq.com 2023-02-10 11:40 出处:网络 作者:在线设计
找到一个基因后优艾设计网_设计百科,怎样看哪里是它的转录起始位点?妹纸真俊

找到一个基因后优艾设计网_设计百科,怎样看哪里是它的转录起始位点?
妹纸真俊 优艾设计网_Photoshop论坛 2021-08-29 18:52


转录起始位点是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤(A或G)。一般转录起始位点的上游都有雨RNA聚合酶结合的启动子区域。
1.确定自己做的那个物种有没有基因组序列,如果有在NCBI中先找到自己要做的基因,找到基因组序列,做blast后在基因组上选取上游的大概1000多个碱基,然后用软件分析,;2.如果没有基因组序列,就需要用染色体位移技术,先克隆到哪个序列,接着用软件做分析,通过实验验证,才能完全确定你需要的转录起始位点。


M30****9401 2021-08-29 18:56

优艾设计网_电脑技术
转录起始位点是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤(A或G)。一般转录起始位点的上游都有雨RNA聚合酶结合的启动子区域,是不是可以根据这个来大致确定一下你的转录起始位点。
1.原核生物中,绝大部分启动子都存在-10bp处的TATA区和-35bp处的TTGACA区,它们是RNA聚合酶和启动子的结合位点,然后看看它大致能不能粗略确定转录起始位点
2.真核生物钟,主要的结合位点是转录起始位点上游-25~-30bp的TATAAA区和-70~-78bp的CCAAT区
3.上NCBI上看看通过基因序列,能不能确定你的转录起始位点。


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