在线Blast比对平台是基于千种植物转录组项目(OneKP Project)的数据集而建立的。其中,OneKP项目是由加拿大科学家在2008年11月发起,由深圳华大基因研究院负责对1000多种植物包括藻类、陆地及水生植物的转录组进行测序,在进化分析及植物功能注释分析上已取得大量成果。该平台收录了该项目的所有测序数据,并依托深圳华大基因研究院强大的计算资源,提供在线Blast分析服务。截止至2014年9月22日,已有注册用户631人,已完优艾设计网_Photoshop百科成任务量48456个。目前,OneKP项目的数据将通过该平台逐步公开。
该平台包括5个blast工具,即blastn、tblastn、tblastx、blastp、blastx,可针对性的选择参考物种数据集,使得数据分析的针对性更高,这是植物研究者们的一大福音。
平台网址:http://www.bioinfodata.org/app/Blast4OneKP/
昨日重现uu 2021-09-05 20:34 优艾设计网_设计模板
好用
北北大北妞 优艾设计网_设计模板 2021-09-05 20:48
很大一部分人在使用。在线Blast比对平台是基于千种植物转录组项目的数据集而建立的。该平台收录了该项目的所有测序数据,并依托深圳华大基因研究院强大的计算资源,提供在线Blast分析服务。目前,OneKP项目的数据将通过该平台逐步公开。
龚静静 2021-09-05 20:59
这批数据很好,规范程度较高,可用性强。
这种服务方式用户很熟悉,用了十几年了,可以考虑更新一下。比如送到AWS上去,也可以开放接口,支持大规模的比对,适当收点费也O优艾设计网_在线设计K。同时Blast未免单调,加一点其他的工具和数据库做点联合分析就更赞了。技术资源充足的话可以考虑鼓励用户接入自己的工具,共享比对和分析结果,再整两个人将新的用户数据合并入库,那就牛掰了。扯远了,这要是都实现了,就秒了DNANEXUS
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