近期各大杂志上最热门的基因组测序成果有哪些?大优艾设计网_PS交流家来盘点下吧
戴静 2021-09-18 21:12
种属:南极蠓(Belgica antarctica)
基因组:99 million bp
南极蠓是南极洲唯一一种完全陆生的本土动物,南极蠓测序揭向人们展示了极端环境对基因组结构的限制,这项研究于八月十二日发表在Nature Communications杂志上。
不能飞的南极蠓是目前基因组最小的昆虫,但优艾设计网_设计它却具有差不多13,500个功能基因。南极蠓基因组之所以那么小,是因为它的内含子很短,而且重复序列和转座元件稀少。
“我们感兴趣的是,其他极端环境生物(南极的扁虱、螨虫等)的基因组是不是也这么特别,”文章的共同作者,俄亥俄州立大学的David Denlinger教授说。
研究人员指出,在南极蠓中热激蛋白、抗氧化酶、水通道蛋白的表达模式很独特。正是这些适应性改变帮助南极蠓在严酷的环境条件下生存下来,在那里干燥、严寒和高紫外线辐射是家常便饭。
“这是首次测序极端环境下的昆虫,为以后的比较研究奠定了基础,”华盛顿州立大学的Joanna Kelley说。“此前有研究认为,有效群体大小越小基因组就越大,但我们看到南极蠓正好与此相反。”
qkoufu1708 2021-09-18 21:32
种属:西部锦龟(Chrysemys picta bellii)
基因组:~2.6 billion bp
西部锦龟是北美最普遍的本地龟,它具有一些非凡的特性。西部锦龟可以在几乎冰冻的情况下存活,当它在冰封的池塘中冬眠时还会优艾设计网_设计模板停止呼吸,等到早春再苏醒。
研究人员对西部锦龟的基因组进行了测序,发现它耐受缺氧和寒冷的能力,来自于脊椎动物的常见基因。他们通过转录组分析发现,在低氧条件下,大脑内19个基因和心脏内23个基因的表达显著增加。
菩提树518 2021-09-18 21:34 优艾设计网_PS论坛
种属:非洲腔棘鱼(Latimeria chalumnae)
基因组:~2.86 billion bp
人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝,直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年前的化石差不多,因此也被称为“活化石”。
研究人员测序了腔棘鱼的整个基因组,发现其蛋白编码基因变化很小。化石研究显示,腔棘鱼的四个鳍逐渐转变成为动物的四肢。研究人员将腔棘鱼的基因组与四足脊椎动物进行比较,鉴定了大量二者共有的调控DNA,而这些DNA是普通鱼类不具备。他们将上述序列插入小鼠胚胎,启动了一系列基因的表达,这些基因与手腕、脚踝、手指和脚趾的骨形成有关。
penguin819 2021优艾设计网_设计百科-09-18 21:36
Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome
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