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《Science》报道"跳跃基因"介导癌症基因组中的非重复DNA转导??

优艾设计网 https://www.uibq.com 2023-02-23 11:38 出处:网络 作者:PS抠图
萝莉收割机w 2021-10-11 05:20 由韦尔科姆基金会桑格学院研究所领导的一个研究组在新研究中,只鉴别出72个LINE-1元件在癌症基因组中复制了自身,并发现LINE-1的甲基化对开关这些元件起至关重要的作用。这提示了
萝莉收割机w 2021-10-11 05:20


由韦尔科姆基金会桑格学院研究所领导的一个研究组在新研究中,只鉴别出72个LINE-1元件在癌症基因组中复制了自身,并发现LINE-1的甲基化对开关这些元件起至关重要的作用。这提示了一些有关环境因素对肿瘤演化影响的问题。17%的人类基因组都是由称作为LINE-1元件的“寄生”重复dna片段构成,有时候这些LINE-1会自我复制并移动到基因组中新的位点。较为少见的是,它们会异常地捡起一块邻近的非LINE-1 DNA,将它复制到新的位点:这一过程被称之为LINE-1转导。
通过检测来自12种不同癌症类型的优艾设计网_在线设计290个肿瘤样本,由领导韦尔科姆基金会桑格学院研究所的一个研究组发现了LINE-1元件唯独在肿瘤中被动员的3,000个位点。在24%的位点中,LINE-1将一些非重复DNA片段转导到了基因组的其他位点,有时候动员了外显子,甚至整个基因。研究人员认为,这有可能是由于一些环境因素导致的甲基化水平发生改变所引起。
研究人员开发出了一种算法来搜索癌症样本基因组,鉴别出了一些移动LINE-1元件的起始位点和随后的位置。引人注目的是,从人类基因组的500,000个LINE-1元件中,该研究只鉴别出72个LINE-1元件在癌症基因组中复制了自身。有两个LINE-1元件导致了该研究中鉴别的三分之一的转导事件。研究人员还在一个肿瘤中随时间分析了LINE-1元件的活性。他们发现一些不同的元件在不同的位点活化和失活。


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