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人重测序分析的对比库选择哪个呢??

优艾设计网 https://www.uibq.com 2023-02-28 14:42 出处:网络 作者:PS自学
目前有提供NCBI、EMBL、千人基因组、UCSC、炎黄一号等人类全基因组数据库,我们在生物信息分析时选用哪个更合适呢?在进行中国人的重测优艾设计网_设计序时选择哪个作为参考序列呢?公马请爱惜西

目前有提供NCBI、EMBL、千人基因组、UCSC、炎黄一号等人类全基因组数据库,我们在生物信息分析时选用哪个更合适呢?在进行中国人的重测优艾设计网_设计序时选择哪个作为参考序列呢?
公马请爱惜西 2021-10-29 11:30


现在已经测出的人类基因组的数量,保守估计都应该在十万以上;当然也会保存在不同的数据库中,可能同一个样本的数据也会存储在不同的数据库中,除了楼主表述的之外,现在比较常用的还有日本的DJJB,另外我们中国的基因库也已经上线运行了,楼主可以关注下优艾设计网_PS论坛
至于在科学研究中,用哪个参考基因组,有两种情况,如果没有指定,那就选择NCBI中最常用的那个就行了;如果你用的某个细胞系做实验,最好选用它已经发表的基因组数据;
如果中国人进行重测序时,用炎黄一号基因组应该没错的~


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