人MHC捕获测序有什么作用？？？

jonedream 2021-10-31 10:06

人MHC捕获测序技术是华大科技与NimbleGen合作开发，针对人主要组织相容性复合体MHC相关变异进行检测的技术平台。通过特制探针对人MHC核心区3.37Mb及侧翼区1.6Mb进行捕获，富集后进行高通量测序，针对这一特定基因区域进行针对性研究。该方法极大地提高了基因组中MHC区域的研究效率，具有通量高、成本低、结果准确等优势，可广泛应用于自身免疫性疾病、癌症、器官移植、群体进化、法医鉴定等领域。

其优势有：
1、数据利用度高：利用少量的数据即可高深度覆盖人MHC相关区域，针对性强；
2、覆盖度高：捕获区域大，目标区域的覆盖度≥97%；
3、可分型数目多：可以对MHC区域的26个基因进行分型；
4、分型准确率高：分型准确率达到95%以上。

优艾设计网_Photoshop问答研究内容：
一、标准信息分析
1、去除接头污染和低质量数据；
2、使用比对软件将clean reads比对到人基因组上，并统计产出数据；
3、SNP检测，注释和统计；
4、InDel检测，注释和统计；
5、26个基因的HLA分型；

二、 高级信息分析
1、SNP，InDel与疾病的关联分析；
2、26个基因的HLA型别与疾病的关联分析。

具体可参考：http://www.bgitechsolutions.cn ... -mhc/

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左边安宁 2021-10-31 10:20

由华大基因和罗氏NimbleGen共同开发，采用NimbleGen SeqCap EZ Choice 优艾设计网_设计圈Library定制型液相序列捕获产品，专门针对人MHC核心区3.37Mb及侧翼区1.6Mb进行捕获，成功实现了对常规扩增方法难以实现的高重复区域的高覆盖和有效富集。
这个新方案可以轻松捕获和富集人MHC高重复性区域，克服传统PCR和基因组富集方法的局限性，可用于疾病和药物研究领域。

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