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请说下proton测序仪的测序原理?

优艾设计网 https://www.uibq.com 2023-03-04 11:35 出处:网络 作者:磨皮美容教程
优艾设计网_PS交流如题。360U2578738524 2021-11-12 13:28 IonProton™系统提供了简单的端到端工作流程,可快速获得高质量的测序结果  IonTorrent备受期待的IonProton™系统可使外显子组、全转录组和人类基因

优艾设计网_PS交流如题。
360U2578738524 2021-11-12 13:28


IonProton™系统提供了简单的端到端工作流程,可快速获得高质量的测序结果
  IonTorrent备受期待的IonProton™系统可使外显子组、全转录组和人类基因组规模的测序变得前所未有的方便、经济。
  IonPI™芯片适用于外显子组和转录组测序,是简单、全面的工作流程——从文库制备到数据分析——的一部分。
  IonPII™芯片可用于人类基因组规模的测序,预计将于IonProton™系统推出后约6个月问世。
  IonProton™系统工作流程包括优化的文库试剂盒、自动化模板制备、快速测序运行和集成数据分析解决方案。
2.1 1 文库构造
  Ion文库试剂盒提供了简单的高性能文库解决方案,与Ion半导体测序系统结合使用,可用于外显子组、转录组、基因组和靶点测序。
2.2 2 模板制备
  IonChef™系统
†将为各种专业知识的用户提供高通量的自动化模板制备和芯片加载。较低通量的用户可选择现已有售的IonOneTouch™2系统,实现全自动模板制备。
2.3 3 运行测序
  Proton™Torrent服务器预加载了TorrentSuite软件,可用于碱基检测、作图、校准和变异体检测。变异体可加载至IonReporter™软件中,用于生物学阐释和常见变异体的鉴定。
2.4 4 分析数据
  测序分析获得的数据自动传至装有TorrentSuite软件的Proton™Torrent服务器。Torrent软件套装将原始的电压半导体测优艾设计网_平面设计序数据处理为DNA碱基序列。
3 系统数据处理
3.1 采用先进的硬件可实现一天基因组测序
  IonProton™系统是能够实现$1,000基因组的唯一测序平台*。它将是可在一天内提供人类基因组规模分析的第一台仪器系统,包括数据处理、碱基检测和变异体检测。
  IonProton™系统采用半导体技术,可提供在几个小时内完成测序所需的速度,而且利用IonProton™测序仪中先进的电子设备,能够一天内在Proton™Torrent服务器——IonProton™系统附带的简单的台式服务器——上实现变异体检测。
  IonProton™测序仪采用了最新、最先进的计算硬件(图形处理器(GPU)和现场可编程门阵列(FPGA)技术),可在测序仪内部实现密集型计算数据处理。随后在Proton™Torrent服务器上进行计算密集程度较低的碱基检测和变异体检测。
  IonProton™系统将提供前所未有的速度和价格优势,可在台式测序仪和台式服务器上实现外显子组、转录组和人类基因组测序,而直到现在,完成这些操作仍需体积较大的测序仪和高端集群。
4 优势
  新的IonProton™测序仪更上一层楼.凭借密度比IonPGM™测序仪高1000倍的芯片,IonProton™测序仪将使得全基因组测序对每个实验室都触手可及.
  新的IonProton™测序仪是基于新一代的半导体测序技术,此技术已让IonPGM™测序仪成为世界上销售最快的测序仪.新的高通量芯片将实现让IonProton™测序仪与IonPGM™测序仪相当的运行单日流程,来完成单个人类基因组的测序.
  IonProton™台式测序仪,适合于每个实验室,各种应用,各种预算。
  IonProton测序仪,快速、简捷、扩展,独一无二的台式基因组中心。
5 主要应用领域
  ♦ 扩增子测序
扩增子测序是指利用PCR技术将基因组序列中的某个特定区域扩增出来进行测序,在临床上有极大的应用。针对PGMTM测序仪,自主研发了扩增子测序高通量序列拼接、比对和分析程序,并与独有的微生物分子标识数据库相结合,将能将微生物菌株鉴定到种属、血清型甚至菌株水平。
♦ RNA单链测序
RNA单链测序在转录组测序分析和small RNA测序分析领域具有重要应用价值,但目前市场上缺少原核生物RNA单链测序的试剂盒。结合前期积累的原核生物核糖体RNA消除技术,利用PGMTM测序仪建立了原核生物RNA单链测序标准化操作规程,并自主研发了配套的生物信息学分析程序,为原核生物的转录组测序和small RNA测序提供平台和技术基础。
♦ 基因组及宏基因组测序
与新一代测序相比,PGMTM测序仪具有更好的测序覆盖均衡度,可以测序获得新一代测序无法获得的区域。将PGMTM测序仪与高通量的新一代测序仪(Solexa、Roche 454等)结合使用,可应用于基因组及宏基因组测序领域。


qkoufu9524 优艾设计网_设计 2021-11-12 13:30


ion proton活不久了,开发该产品的首席已经走了,加盟三代测序去了。刚开始的454,他走了不多久,倒了。然后他开发了PGM,然后是proton,现在PGM基本废了。而P2也出不来了。现在又走了,估计不多久,Ion系列也要面临生存问题了。


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