吴若华身为银行的柜台办理员，因为贪图金钱利益，私下替他人转移资金，被恐怖分子引入陷阱于家中被控制。田克楠和周扬蹲守在吴若华家门口，在恐怖分子开门瞬间成功控制住两名人质，但恐怖分子一共有三名，剩下一人立刻掏出枪对准了吴若华的脑袋。恐怖分子要求周扬放下枪，周扬放下枪后恐怖分子放开了吴若华，田克楠立即朝着恐怖分子开枪爆头。钟原带着两名从其它战队调来的队员亲自伪装成游泳池管理员，贴身保护百米自由泳运动员贺修光。游泳馆门口停着一辆可疑车辆，一直在原地没有动过，钟原要求乔大鹏上前去查看并拍下车内人像。乔大鹏借口抽烟没有打火机，成功拍摄到了车内人的照片。车内人正是猛犸组织内的恐怖分子，只是人数较少只有两人，钟原认为肯定还有别的恐怖分子会出现，极大可能会对泳池下手，于是决定先把贺修光控制在自己的安全范围内。果然，不久后游泳池突然发生了爆炸，钟原的判断得到了验证。为了迷惑恐怖分子，钟原在泳池里放置了特战队员，浮在水面伪装成被炸死的贺修光。陆豪亲自带着苏娅等人伪装成医护人员，劫持了一辆救护车，推着救护床进入游泳池。陆豪看见游泳池入口有监控，特意露出全脸对着摄像头静止了一会儿。苏娅引着手下推车进入游泳池，陆豪跟上来准备打捞“贺修光”提取血清。
指挥长看到陆豪的全脸之后，立刻呼叫钟原不要开枪，恐怖分子里有六号。钟原冲着泳池水开了一枪，把苏娅和其它恐怖分子吓退，陆豪走上前和钟原接头，告诉钟原此次巴摩尔不仅仅派了自己和苏娅，暗中派了肖恩来到国内，怀疑肖恩是另有任务。事实证明陆豪的怀疑是正确的，肖恩接受江寒的指令，在DK的停车场将前来等候江寒约会的尹菲菲劫持，借此威胁携带病毒的胡可前来营救。胡可对尹菲菲喜欢得不得了，为了尹菲菲不惜以命换命，肖恩摁住胡可提取了血清，装在密码箱里准备带走。这时，收到消息的特战队员赶到，对着恐怖分子一顿扫射，混乱之间密码箱掉在了地上，肖恩想要伸手去拿却被猛烈的炮火挡了回来，不得已为了保命肖恩抛下手下逃命。胡可的右腿被肖恩打伤，尹菲菲也吓晕了。两人被火速送入医院医治，胡可醒来后钟原代替赵欣前去慰问，胡可看见钟原便询问尹菲菲的情况。钟原告诉胡可尹菲菲被江寒亲自接走了，胡可一时之间愣住了。钟原安慰胡可不要多想，好好地在医院养伤，看望任务结束钟原准备转身离开之际，胡可叫住钟原，告诉钟原自己的TUM值失常后，胡可偷偷地做过实验。经过多次实验，胡可发现自己体内的病毒只要和M系列的结合就会对人体产生巨大的危害，往小里说会对人体的生育能力产生影响，会造成生育能力下降甚至是丧失。
胡可告诉钟原，自己体内的病毒往广阔的层面讲，会对人类的遗传基因造成影响，最直接的结果就是导致一部分种族的灭绝。当然这只是胡可的一种猜测，有可能没有那么严重。钟原听完后情绪波动幅度很大，病毒被情绪催化导致大脑剧烈地疼痛起来。钟原心里很不是滋味，回想之前赵欣的种种异样，很可能和孩子和自己体内的病毒有关。思来想去，钟原开车来到DK生物公司楼下，犹豫许久才掏出电话给赵欣打电话，要求二十分钟后去接赵欣下班，一起去超市买婴儿用品。赵欣忐忑不安地下了班，打开车门坐上钟原的车，钟原载着赵欣欢欢喜喜地往商场去，一路边开车边叮嘱一会儿抢购一定要快。赵欣再也忍不住了，泪流满面地大喊钟原不要再说下去，钟原立即把车停在路边，看着赵欣逼问是否是孩子出了问题。赵欣没有回答，哭着抱住钟原;钟原质问是否和自己有关系，赵欣立刻摇头否认，坚持是自己的原因。钟原不相信和自己没关系，再三逼问赵欣真正的原因。赵欣不希望和钟原每一次见面都吵架，开门下车要求两个人分开冷静一下。钟原连忙喊住赵欣，把赵欣送回家后自动离开了家回到战队基地内反思自己。为了惩罚自己和麻醉心中的痛苦，钟原睡了一整晚的硬板凳自虐，第二天又在两小时之内进行了七次高强度训练，成绩次次位列第一。钟原完成高强度训练后，心中依旧得不到满足，马不停蹄跑向操场开始狂奔。
指挥长叫来钟原在枪场打靶，告诉钟原孩子夭折的真相确实和钟原体内的病毒有关，而且两个孩子都是直接或间接因为钟原而死。钟原激动地拿起指挥长递过来的机关枪一阵扫射，指挥长又继续平静地说了下去，因为钟原体内病毒的存在导致TUM异常，这种病毒产生的异常带给了胎儿，所以孩子才胎死腹中。钟原连日来都在基地休息睡觉，几乎都不回家去，麦萌萌看优艾设计网_Photoshop交流出了钟原的异常，趁着和赵欣接头的机会顺势询问，赵欣坦白钟原已经知道了孩子夭折的事，至于原因也已经猜了个七七八八。麦萌萌向赵欣索取江寒的情报，赵欣把方才江寒试探自己是否知道胡可和尹菲菲被绑架的事，告诉了麦萌萌。虽然江寒这么问了，但是江寒了解自己不爱八卦，因此不会太纠结回答的真实性。江寒和尚征给巴摩尔下达的多次任务均以失败告终，巴摩尔大怒要求见一见江寒。尚征本想糊弄过关，无奈巴摩尔咬死尚征不是MVC的惊雷，只好和江寒一起去见巴摩尔。巴摩尔要求把下一次任务的报酬从五千万涨价到八千万以上，否则就一拍两散，为了达到目的巴摩尔拔出枪近距离地指着江寒的头。江寒一把抢过手枪转而威胁巴摩尔，告诉巴摩尔这把枪里一共有八发子弹，而巴摩尔的人只有五个，三十秒内强杀巴摩尔再干掉所有手下，自己有的是信心和机会。为了证明自己的话，江寒背对着一盏灯，，开枪击中。江寒交和巴摩尔的商谈最终获得胜利，巴摩尔带着手下从中国返回F国境内，派出手下四处绑架游客或当地人用来注射病毒做实验。据新闻报道，已发生十八起人口失踪案，这些失踪案件的始作俑者还未抓获，失踪者也没有找到.....
陆豪和肖恩在酒吧喝酒时看见新闻播报，肖恩立刻恭喜陆豪得到的信任比自己多，大面积的绑架案只有猛犸组织做得到，而巴摩尔没有交给自己来做，那肯定就是交给了陆豪;陆豪告诉肖恩这件事不是自己做的，自己根本不知道有这个任务。陆豪走出酒吧四处观望确定无人之后，才掏出电话给指挥长打电话，报告了巴摩指使苏娅在F国大肆抓捕人质，但是自己和肖恩都不知道人质被抓到了哪里。打完电话后，陆豪随手把手机扔进河里毁灭证据。陆豪的猜测再一次应验，苏娅替巴摩尔抓了一批人质到一栋旅游别墅内，巴摩尔答应事后给苏娅五个亿带着陆豪远走高飞。人质被强制蹲在地上，巴摩尔提醒人质会被注射病毒，存活几率将有百分之五十，但是如果不配合存活几率就是零。有一名人质不信邪，站起来威胁巴摩尔有本事就把自己打死，巴摩尔满足了人质的要求，一枪把人质打死。其余人质闻到浓烈的血腥味，听到枪声后立刻变得害怕起来;巴摩尔吩咐手下上千给人质注射病毒，人质挣扎中将一支病毒打落在垃圾桶旁。晚上，苏娅开车回到基地找陆豪撒娇，陆豪处处躲着苏娅的勾引和示爱。苏娅主动把这两天自己做的事告诉了陆豪，陆豪拒绝打听自己不该知道的事，主动把房间让给苏娅，借口出门闲晃从苏娅所用车辆的车牌后拿出定位手机。根据定位手机上的位置显示，陆豪找到了那栋别墅，趁着晚上没人偷偷地搜查别墅，在垃圾桶旁边找到了那支遗留的病毒。陆豪用纸巾把病毒包起来，寄回战队基地交给化验室化验。化验师化验后确认这是一种新型病毒，是之前M1和M2的结合体在潜藏L1和L2病毒人体内进行结合变异，之后出现的变异种病毒M4。
钟原在战队基地住了将近一个礼拜后，开车回到家把所有关于自己的东西都用收纳箱拿回了基地的宿舍，包括家中那张放在抽屉里一家三口(鹏鹏)的合照也带走了。钟原开车回到宿舍楼下搬东西，麦萌萌恰巧撞见了这一幕，追上去一通胡劝。钟原对于麦萌萌的举动感到莫名其妙，不听买萌萌的劝说自顾自理东西;麦萌萌把钟原赶了出去，主动帮钟原收拾屋子。麦萌萌把钟原的反常情况告诉了指挥长，指挥长要求麦萌萌贴身保护赵欣，全天二十四小时都不能离开。赵欣拜托麦萌萌把自己送回家，麦萌萌停下车在草地上等赵欣，赵欣回家后不久便出了门，拦下另一辆出租赶往特战队基地质问钟原。钟原很平静地告诉赵欣，自己决定离婚。赵欣听后心情很复杂，转身就离开了宿舍楼往外走，麦萌萌追着赵欣而来，又追着赵欣到宿舍楼下。赵欣拜托麦萌萌好好地照顾钟原，麦萌萌愣在原地不知所措。赵欣回到DK生物公司继续上班，江寒给了赵欣一份文件，F国出现了十几例和钟原类似的病毒感染体，F国政府听说DK生物公司在这方面有研究，送出邀请希望DK生物公司能够派几个这方面的专家一起研究。江寒选择了胡可和赵欣一起去，赵欣听得心不在焉满心在想江寒让胡可去F国的目的。江寒看到赵欣不再听，便询问赵欣发呆原因;赵欣以钟原要和自己离婚作为借口搪塞了过去，没想到江寒提出要以朋友的身份去见一见钟原，谈一谈赵欣和钟原离婚的事。赵欣按照指挥长的指示同意了江寒的要求，江寒来到战队基地找钟原，两人在基地附近的公园谈话。钟原的便装上衣领子下放置了微型录音机，指挥控制室实时进行监听。江寒问起钟原提出离婚的原因，钟原假装不知道江寒身份的样子，把自己在执行任务时感染病毒的事告诉江寒。
胡可约赵欣下班后见面，赵欣一头雾水地答应了，下班后前往转角咖啡厅见胡可，一见面胡可便询问赵欣是否想去F国出差。公差且全程包吃包住不用自掏腰包，赵欣当然愿意去F国。但是胡可不太想去F国，自从上次的绑架听到人生中第一次枪响之后，再加上自己体内TUM值得异常波动，自己还是心有余悸不敢去F国。因此，胡可拜托赵欣和江寒沟通沟通，希望江寒能够换一个人去。江寒特意请了一天假陪着尹菲菲在露天咖啡厅喝东西，尹菲菲感动于江寒对自己的好，什么事都听江寒的吩咐。江寒把尹菲菲带回了家，美其名曰体会一下家的感觉;两人在江寒家中一阵翻云覆雨，事后江寒假装忧愁的样子在窗边吸烟，勾起了尹菲菲的怜爱之心。江寒哄骗尹菲菲自己欠了银行很多债，每个月都要还七万元的款项给银行，因此经常失眠精神不振。尹菲菲心疼江寒为了工作和还款整日劳累奔波，主动提出要尽自己的力量帮一把江寒;江寒顺势提出要尹菲菲打电话劝一劝胡可，因为F国的出差对于公司很重要。尹菲菲答应了江寒，转身便给胡可拨打了电话。赵欣按照指挥长的指令，把胡可约到咖啡厅见面，当面摊牌自己的军方身份，软硬兼施拉拢胡可。为了让胡可相信自己的身份和军方的实力，赵欣让麦萌萌监视了胡可一整天，并把这一天内胡可做过的所有事情都一一复述给胡可听。胡可听得一愣一愣的，最终还是答应了赵欣的请求，和赵欣一起去F国出差。
赵欣把胡可的反应转达给指挥长，指挥长吩咐参谋长向F国提出持枪带械进入F国境内，对胡可进行武力保护。指挥长命令赵欣先从任务中撤出，为了安全不要去F国;赵欣坚持要去F国执行任务，苦口婆心劝服了指挥长和参谋长。任务完成之后，赵欣回到家对着一家三口的照片发呆，良久掏出电话打给钟原，同意离婚的要求。第二天一早，两人带着结婚证来到民政局办理离婚，负责受理的工作人员见两人态度坚决，也省了劝说的步骤，敲章后把离婚证给了两人。赵欣和钟原拿着离婚证在民政局门口互相看了一眼，最终还是分道扬镳。离婚之后，赵欣把重心都放在了研究Z9上，日夜兼程地在实验室内做实验，直到尚征带着团队启程去F国出差为止。因为F国军方不同意中方携带枪械入境，参谋长派出麦萌萌以平民的身份飞往F国，配合F国军方共同保护赵欣和胡可。麦萌萌下飞后与F国此次行动指挥拉达碰面，拉达的团队开面包车一路尾随赵欣、胡可等人所乘的商务车，突然路上发生了堵车;两辆车之间隔了许多车，麦萌萌伸长了脖子也看不到赵欣的车。情急之下麦萌萌打开车门直接追上去看，被拉达的同僚抓了回来并铐在车把手上，拉达命令麦萌萌闭上嘴，听自己的安排继续跟踪那辆商务车。
但麦萌萌观察的很仔细，那辆商务车的车胎变了，不像是四五个人的重量状态，大喊要求拉达停车。拉达停车上千拦下商务车查看，车内只剩下了一个司机，其他人都不见了。麦萌萌要求拉达转方向去左边追，面包车逐渐驶入一条偏僻的林间小道，小道转弯处突然出现了一大批恐怖分子，看见面包车就是一阵子弹扫射。车上所有人都下了车，麦萌萌拔出拉达身上的手枪，以精准的枪法消灭了不少恐怖分子。拉达见麦萌萌不遵守F国规定非法持枪，立刻把枪抢走不允许麦萌萌开枪;话音刚落拉达便被子弹打中受伤。麦萌萌直接拿出拉达身上的手榴弹拔了针扔向恐怖分子，成功炸死了几个人;趁着恐怖分子还没反应过来，麦萌萌端起冲锋枪就往上冲，将所有的恐怖分子一网打尽。麦萌萌上前搜查面包车发现里面一个人都没有，赵欣等人恐怕早就被转移了。就在堵车的时候，巴摩尔派人把赵欣等人都抓到了自己的基地内，赵欣和胡可被安排在同一个牢房内。赵欣安慰胡可不要害怕，猛犸组织让胡可干什么就做什么，如果要求合成M4就听他们的，但是要尽量拖延时间，能有多慢就有多慢。
高速公路上，猛犸成员劫持了赵欣、胡可。猛犸秘密基地，尚征依旧在赵欣、胡可面前扮演着人质的角色。巴摩尔按照江寒的计划，并没有难为赵欣，只是把她关押了起来。胡可在巴摩尔的威逼下，开始替其研究M4病毒。上次行动中被猎影小组抢尽了风头，这让马文上校很是不爽，他一定要在这次联合行动中争回这个面子。
他带领队伍略显冒进地快速推进着，钟原则带领猎影小组亦步亦趋，稳扎稳打。巴摩尔并未被军方的佯攻所动，他相信对方并不知道自己的具体地点，而且他已有安排。大火把森林清理出一条空旷的地带，任何人走到这片地带上，都将成为活靶子，这就是巴摩尔的计划。
猛犸后方，二十几个恐怖分子正对着空地上的政府军疯狂扫射着。猎影小组悄悄地从后方摸上，一个个衣衫褴褛但精神矍铄。猎影小组众人在没有武器的情况下，成功偷袭，放倒了所有的恐怖分子救下马文上校等人。在了解到钟原识破敌人计谋，冒险穿越火场之后。马文上校不禁对钟原竖起了大拇指。巴摩尔终于坐不住了，他命令肖恩和陆豪分别到秘密基地附近保卫，但依旧未对二人说明基地的具体位置。肖恩到达预定地点，带领众匪积极地布置起坚固的防御工事，钟原带领猎影小组也到达了。
经过一番艰苦的鏖战，钟原带领全组人员拿下了这个据点，但肖恩逃脱。肖恩失守，巴摩尔急速命令陆豪到秘密基地防卫。在知道巴摩尔的具体位置后，陆豪把众手下的位置透露给马文上校，自己则快速赶往猛犸秘密基地。巴摩尔意识到军方马上就要攻过来了。他以赵欣的生命相要挟，胡可不得不答应10分钟之内一定配制出M4。此时，陆豪也来到了猛犸基地。在打探到人质的具体关押地点后，把手机扔在了实验室门外暗处。技术人员通过手机定位，调来卫星得到了整个恐怖基地的画面。与此同时，M4已经研制成功被装进液氮低温箱。就在尚征拎着液氮低温箱准备离开的时候，被卫星捕捉到了画面。马文上校经过一番鏖战，夺下了藏有M4的液氮低温箱。但尚征趁乱逃走。
巴摩尔见到大势已去，带着肖恩和陆豪，绑架赵欣和胡可为人质，快速乘车逃离。钟原等人乘坐直升飞机追击巴摩尔，一番空地对战之后。钟原成功救下胡可和赵欣，巴摩尔不想被捕而跳崖。陆豪跟随肖恩逃跑，继续执行潜伏任务。
尚征一回到酒店，就被F国警方控制起来。尚征以恐怖分子放自己出来拿赎金为由暂时蒙混了过去，但依旧被软禁在酒店等候调查结果。丢失M4让尚征坐立不安。因为他很了解MVC对待失败者的手段，他没有联系江寒，思索着对策。
尚征终于找到机会，在F国警方的层层监护下逃走，消失在众人的视线里。F国警方立即派人前往中国，准备着手清查DK公司。国内，赵剑平意识到了这些事情的蹊跷，出于关心爱徒（江寒），他找到胡可，询问发生在F国的情况，意外获悉赵欣离婚一事。没有人比他更了解钟原和赵欣的感情了，他意识到这件事情一定和工作有关。
数次行动的失利，让MVC对江寒失去了耐心。某夜，亨利带领手下持枪（MVC杀手）出现在江寒办公室代表MVC对其进行问责。江寒从亨利处争取到3个月的时间，积极地计划着下一步的行动。在把M4交给尚征之前，巴摩尔私自备份了一份M4样本。
尚征抢下了M4病毒后逃之夭夭。巴摩尔气急败坏地通知了江寒。江寒终于接到了尚征的电话，电话里。尚征要把M4卖给江寒换取跑路钱，如果江寒不从就把江寒的所作所为公之于众，江寒不得不答应了尚征的要求。
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